25 vjet pas vdekjes, Muharrem Bajraktari u nderua në Bruksel me një pllakë përkujtimore. Duke i njohur kontributin si atdhetar e luftëtar kundër nazi-fashizmit e komunizmit, homazhet u zhvilluan në komunën e Skarbekut, ku ai jetoi gjatë viteve të mërgimit, nga viti 1964 deri në 1989, kur u nda nga jeta.