Hekurudha Shqiptare do të ndahet në dy shoqëri aksionare. Pas emërimit të Ergys Vedhos në krye të shoqërisë së hekurudhës shqiptare, është hedhur për konsultim publik një draft që parashikon ndarjen e kësaj shoqërie në shoqëeinë aksionare për infrastrukturën hekurudhore dhe shoqërinë Hekurudhore për transportin e udhëtarëve dhe mallrave, si dhe për mirëmbajtjen e mjeteve lëvizëse. Në draft thuhet se kjo ka qënë një kërkesë e vazhdueshme nga Bashkimi Europian, për të bërë të mundur rregullimin e këtij sektori në përputhje me legjislacionin e BE, pasi çdo investitor i mundshëm i huaj në fushën e transportit hekurudhor, si dhe çdo projekt i financuar nga BE kërkon që të bashkëpunojë me administratorin e infrastrukturës që ka llogari të pastra nga çdo operues apo transportues në infrastrukturën e tij.