Një numër I madh organizatash I bazuar në ideologjinë Vëllazërisë Myslimane, janë përhapur në pjesë të Federatës së Bosnjës dhe Hercegovinës. Vëllazëria Myslimane është organizata më e madhe dhe më me ndikim islamiste sunite. Ajo ka krijuar grupe të shumta terroriste, përfshirë Hamasin. Sipas një hulumtimi, Vëllazëria Myslimane në Bosnje dhe Hercegovinë fitoi forcë pas themelimit të SDA-së, Partisë së Veprimit Demokratik të boshnjakëve.