Më shumë se 90 % e rasteve të infertilitetit mashkullor ndodhin për shkak të sasisë së pakët të spermës, cilësisë së dobët të spermatozoidëve, ose të dyja bashkë. Gjithashtu infertiliteti mashkullor mund të shkaktohet edhe nga një numër faktorësh të tjerë duke përfshirë këtu problemet anatomike, çrregullimet hormonale dhe defektet gjenetike. Anomalitë e spermës kategorizohen në bazë të numrit të spermatozoidëve, lëvizjes dhe formës se tyre.