2006- Qëllimi i parë ndërkombëtar: Në mars të këtij viti Messi shënoi golin e tij të parë për Argjentinën, në miqësoren që kjo e fundit e humbi kundër Kroacisë. Po në këtë vit, Messi do të debutonte në Kupën e Botës. Ai u aktivizua në minutën e 74-ërt kundër Serbisë dhe Malit të Zi. Ai do të behej kështu në lojtarin më të ri me moshë që ka luajtur me Argjentinën në një komepticion kaq madhor siç është Kupa e Botës. Ai shënoi golin e fundit në një fitore 6-0, duke u bërë shënuesi më i ri në turne dhe golashënuesi i gjashtë më i ri në historinë e turneut.